De geur van de ontlasting houdt voornamelijk verband met rottingsprocessen die de aminozuren aantasten die ontsnapt zijn uit de darmopname. Deze voedingsstoffen worden in feite onderschept door de darmbacteriën en ondergaan een decarboxyleringsproces dat de volgende giftige amines produceert:
arginine → agmatine
cystine en cysteïne → mercaptan
histidine → histamine
lysine → cadaverine
ornithine → putrescine
tyrosine → tiratina
tryptofaan → indool en skatol
Veel van deze stoffen geven de ontlasting een bijzonder onaangename geur. De ontlasting wordt nogal onwelriekend, zelfs wanneer ze lange tijd in de darm blijft, evenals in de bovengenoemde gevallen van malabsorptie (coeliakie, pancreasinsufficiëntie, darminfecties, ziekte van Crohn, colitis ulcerosa, kortedarmsyndroom, cystische fibrose, lever ziekte en galwegen en maagaandoeningen die gepaard gaan met hypochloorhydrie). Wanneer de malabsorptie voornamelijk uit eiwitten bestaat, is de geur van de ontlasting misselijkmakend, terwijl het scherp en doordringend wordt wanneer grote hoeveelheden niet-geabsorbeerde of slecht verteerde suikers en zetmeel in de dikke darm terechtkomen en vervolgens worden gefermenteerd door de lokale flora met de productie van vluchtige vetzuren .
De diarree en ontlasting van de vegetariër stinken slecht.
Uitwerpselen met een geur van vis of sperma zijn kenmerkend voor bacillaire dysenterie, cholera en meer in het algemeen van mucorroe.
Samengevat wordt de geur van ontlasting dus beïnvloed door eetgewoonten (hoeveelheid eiwitten, aromatische voedingsmiddelen zoals knoflook of uien, enz.), door bacteriële darmflora, door de gezondheidstoestand en door bepaalde gewoonten (zoals roken of kauwen Over het algemeen helpt de consumptie van kleine en evenwichtige maaltijden, zonder grote hoeveelheden "onverenigbare" voedingsmiddelen (zie gedissocieerde voeding) te associëren met het optimaliseren van spijsverteringsprocessen, het verminderen van de incidentie van aandoeningen zoals meteorisme en winderigheid, en het geven van de ontlasting een sui generis geur.
Elk geval waarin de slechte geur van de ontlasting gepaard gaat met symptomen zoals zwarte, teerachtige of bleke ontlasting, aanwezigheid van bloed in de ontlasting, koorts, koude rillingen, hevige buikkrampen, overvloedige aanwezigheid van slijm in de ontlasting en gewichtsverlies.
