De urinegeur van een gezond en goed gehydrateerd persoon is normaal gesproken "sui generis" en als zodanig vrij van slechte geuren. We hebben het in feite over een normaal aseptische vloeistof, die variabele concentraties afvalstoffen bevat, afhankelijk van het dieet, de gezondheidstoestand en hydratatie en de inname van medicijnen.
Een slechte geur in de urine kan daarom een teken zijn van pathologische aandoeningen, maar niet noodzakelijk.
(die ook de kleur variëren en deze naar het lichtgroen verplaatsen), bloemkool en knoflook gaan meestal gepaard met stinkende urine.(omdat de opgeloste stoffen die verantwoordelijk zijn voor slechte geur hun concentratie verhogen; de urine krijgt zo een bijzonder donkere kleur en een kenmerkend aroma van ammoniak);
Blaasontsteking, urineweginfecties, pyelonefritis (nierinfecties), urethritis, prostatitis en vaginitis (in dit geval is het probleem mogelijk niet gerelateerd aan de urinewegen, gezien de anatomische nabijheid - zie voor meer informatie: vaginale geur);
Leverfalen;
Diabetische ketoacidose en ketonurie (ook typisch voor langdurig vasten, vergezeld van overvloedige urine met een zoetige geur, vergelijkbaar met aceton);
Rectovaginale fistel;
Fenylketonurie (zeldzame ziekte aanwezig vanaf de geboorte);
Vitamine B-6-supplementen nemen
Stofwisselingsziekten;
Ahornsiroop urineziekte (zeldzaam);
Trimethylaminurie of visgeursyndroom (zeldzaam);
Sommige geneesmiddelen kunnen ook de geur van urine veranderen, waaronder sommige antibiotica zoals amoxicilline, ampicilline, nitrofurantoïne, ciprofloxacine, norfloxacine, ofloxacine en trimethoprim.
De oorzaken van een slechte urinegeur kunnen worden onderzocht door middel van een eenvoudige urineanalyse en kweek (om te zoeken naar eventuele bacteriële infecties).