Peptide binding

De peptidebinding is een covalente binding die tot stand komt tussen twee moleculen, wanneer de carboxylgroep van de ene reageert met de aminogroep van de andere door een condensatiereactie (of uitdroging, wat leidt - dat wil zeggen - tot de eliminatie van een watermolecuul ) .

Gewoonlijk wordt de peptidebinding gevormd tussen twee aminozuren, wat resulteert in een dipeptide.

Aangezien een dipeptide in zijn molecuul nog steeds een amino- en een carboxygroep bevat, kan het een peptidebinding vormen met een derde aminozuur, waardoor een tripeptide ontstaat, enzovoort. Wanneer het aantal aminozuren relatief klein is, wordt het oligopeptide genoemd, terwijl als het aantal aminozuren toeneemt, het polypeptide of eiwit wordt genoemd.

In werkelijkheid, ondanks de figuur, is de peptidebinding niet van het eenvoudige type, maar heeft een 60% enkelvoudige binding en 40% een dubbele binding.

In levende organismen wordt de vorming van de peptidebinding gekatalyseerd door een enzym - peptidyltransferase genaamd - dat aanwezig is in de belangrijkste subeenheid van ribosomen.

De eiwitten die in het dieet worden geïntroduceerd, zijn ook opgebouwd uit aminozuurketens die zijn verbonden door peptidebindingen. Tijdens de spijsvertering worden deze bindingen verbroken door bepaalde enzymen (peptidasen) die aanwezig zijn in het maag- en pancreassap. De afzonderlijke aminozuren, die eenmaal door de darm zijn geabsorbeerd, gaan uit het bloed en worden opgenomen door de cellen - vooral de lever - die ze door nieuwe peptidebindingen verenigen om de eiwitten te vormen die ze nodig hebben (niet alleen structurele maar ook hormonale, enzymatische , enz. In de natuur zijn er in feite een groot aantal eiwitten, met verschillende fysisch-chemische kenmerken, die voortkomen uit de verschillende eigenschappen van de 20 gewone aminozuren en uit hoe ze combineren in de polypeptideketen. Denk maar aan een eiwit van 100 aminozuren, daarom relatief klein, het kan bestaan ​​uit 20100 = 1,27 x 10130 mogelijke polypeptideketens.De instructies voor het bouwen van de juiste aminozuurketen zijn opgenomen in het genoom van het individu.