Vanuit chemisch oogpunt is fondaparinux een synthetisch sulfaatpentasaccharide waarvan de chemische structuur is gebaseerd op het actieve deel van de ongefractioneerde heparine.
Net als bij andere heparinegeneesmiddelen, moet fondaparinux parenteraal worden toegediend en in het bijzonder via subcutane injectie om te werken. In sommige gevallen kan het actieve ingrediënt echter ook intraveneus worden toegediend door gespecialiseerd medisch personeel.
In Italië is fondaparinux verkrijgbaar in een enkel geneesmiddel genaamd Arixrtra®. Het geneesmiddel is in de vorm van een gebruiksklare injecteerbare oplossing in voorgevulde spuiten. Om te worden afgeleverd, is een medisch recept vereist. herhaalbaar; aangezien het echter geclassificeerd is als een klasse A-medicijn, kunnen de kosten (zeker hoog) worden vergoed door het National Health System (NHS).
